Διερεύνηση της συσχέτισης γενετικών τόπων με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας σε Καυκάσιους ασθενείς
Η σχιζοφρένεια αποτελεί την πιο σοβαρή και πολύπλοκη ψυχιατρική διαταραχή, η οποία εμφανίζεται σε περίπου 1% του γενικού πληθυσμού. Παρόλο που η αιτιολογία της σχιζοφρένειας παραμένει άγνωστη, είναι γνωστό πως τόσο οι περιβαλλοντικοί όσο και οι γενετικοί παράγοντες παίζουν σημαντικό ρόλο στην εμφά...
| Main Author: | |
|---|---|
| Other Authors: | |
| Format: | Thesis |
| Language: | Greek |
| Published: |
2022
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://hdl.handle.net/10889/24144 |
| id |
nemertes-10889-24144 |
|---|---|
| record_format |
dspace |
| institution |
UPatras |
| collection |
Nemertes |
| language |
Greek |
| topic |
Ποιοτική μετα-ανάλυση Σχιζοφρένεια Γονίδια Γενετική βάση Συσχέτιση Γονότυποι Αλληλόμορφα Καυκάσιοι πληθυσμοί Μη Καυκάσιοι πληθυσμοί Qualitative meta-analysis Schizophrenia Genes Genetic base Association Genotypes Alleles Caucasian cohort Non Caucasian cohort STT3A IL3A MSI2 616.898 071 |
| spellingShingle |
Ποιοτική μετα-ανάλυση Σχιζοφρένεια Γονίδια Γενετική βάση Συσχέτιση Γονότυποι Αλληλόμορφα Καυκάσιοι πληθυσμοί Μη Καυκάσιοι πληθυσμοί Qualitative meta-analysis Schizophrenia Genes Genetic base Association Genotypes Alleles Caucasian cohort Non Caucasian cohort STT3A IL3A MSI2 616.898 071 Χονδρού, Γεωργία Διερεύνηση της συσχέτισης γενετικών τόπων με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας σε Καυκάσιους ασθενείς |
| description |
Η σχιζοφρένεια αποτελεί την πιο σοβαρή και πολύπλοκη ψυχιατρική διαταραχή, η οποία εμφανίζεται σε περίπου 1% του γενικού πληθυσμού.
Παρόλο που η αιτιολογία της σχιζοφρένειας παραμένει άγνωστη, είναι γνωστό πως τόσο οι περιβαλλοντικοί όσο και οι γενετικοί παράγοντες παίζουν σημαντικό ρόλο στην εμφάνισή της. Οι περιβαλλοντικοί παράγοντες αφορούν κυρίως γεγονότα πριν τη γέννηση του ατόμου, επιπλοκές κατά τον τοκετό, λοιμώξεις, τον τόπο και την εποχή γέννησης του ατόμου, καθώς και κοινωνικούς παράγοντες. Ωστόσο, το γενετικό υπόβαθρο του ατόμου φαίνεται να αποτελεί τον πιο ισχυρό παράγοντα επίδρασης στην εμφάνιση της νόσου. Σύμφωνα με μελέτες συσχετισμού ολόκληρου του γονιδιώματος και στρατηγικής υποψήφιων γονιδίων, έχει βρεθεί ότι πολλά γονίδια σχετίζονται με την εμφάνιση της νόσου. Επιπλέον, σύμφωνα με μελέτες που έχουν γίνει σε άτομα της ίδιας οικογένειας, έχει δειχθεί ότι συγγενείς ασθενών με σχιζοφρένεια έχουν μεγαλύτερο κίνδυνο εμφάνισης της νόσου.
Στην παρούσα μελέτη, πραγματοποιήθηκε, αρχικά, βιβλιογραφική ανασκόπηση άρθρων που μελετούσαν γονίδια και γενετικές αλλαγές που σχετίζονταν με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας, ανεξάρτητα από την προέλευση του εξεταζόμενου δείγματος. Συνολικά συλλέχθηκαν 188 μελέτες οι οποίες αφορούσαν Καυκάσιους και μη Καυκάσιους πληθυσμούς. Στις μελέτες αυτές συμμετείχαν συνολικά 393.617 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 620.314 δείγματα αναφοράς. Στη συνέχεια, έγινε ποιοτική μετα-ανάλυση των δεδομένων αυτών και βρέθηκαν 18 γενετικές αλλαγές που εμφάνιζαν στατιστική σημαντικότητα (pvalue < 0.001) και είχαν μελετηθεί αποκλειστικά σε δείγμα μη Καυκάσιων πληθυσμών. Οι γενετικές αλλαγές αυτές αφορούν συνολικά 14 γονίδια, τα οποία κωδικοποιούν μεταγραφικούς παράγοντες, διαμεμβρανικές πρωτεΐνες, γλυκοπρωτεΐνες, ιοντικούς διαύλους και υποδοχείς που παίζουν σημαντικό ρόλο σε ποικίλες κυτταρικές δραστηριότητες και στην ανάπτυξη διαφόρων συστημάτων.
Έπειτα, με κριτήριο την παράμετρο pvalue, επελέγησαν για περαιτέρω μελέτη, σε Καυκάσιους πληθυσμούς, οι πολυμορφισμοί rs548181, rs6645249 και rs9892791. Οι πολυμορφισμοί αυτοί βρίσκονται στα γονίδια STT3A, IL3A και MSI2 αντίστοιχα. Σκοπός της μελέτης αυτής είναι η διερεύνηση της συσχέτισης των γενετικών τόπων αυτών με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας στους εκάστοτε εξεταζόμενους Καυκάσιους πληθυσμούς. Συγκεκριμένα, για τη μελέτη του rs548181 του γονιδίου STT3A γονοτυπήθηκαν, με τη μέθοδο RFLP, 25 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 24 δείγματα αναφοράς ελληνικού πληθυσμού. Επίσης, για τον rs6645249 του IL3A αναλύθηκαν, με τη μέθοδο RFLP, 20 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 33 δείγματα αναφοράς ελληνικού πληθυσμού και 10 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 8 δείγματα αναφοράς σλοβένικου πληθυσμού. Τέλος, ο rs9892791 του MSI2 μελετήθηκε με τη μέθοδο γονοτύπησης Sanger Sequencing σε δείγματα Ελλήνων, Κροατών και Σλοβένων. Αναλυτικά, γονοτυπήθηκαν 14 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 43 δείγματα αναφοράς για τον ελληνικό πληθυσμό, 11 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 39 δείγματα αναφοράς για τον κροατικό πληθυσμό και 19 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 26 δείγματα αναφοράς για τον σλοβένικο πληθυσμό.
Τέλος, πραγματοποιήθηκε στατιστική ανάλυση των αποτελεσμάτων γονοτύπησης των μελετούμενων δειγμάτων, η οποία δεν κατέδειξε στατιστικά σημαντική συσχέτιση των εξεταζόμενων πολυμορφισμών με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας στους εξεταζόμενους πληθυσμούς, ούτε σε επίπεδο γονοτύπων ούτε σε επίπεδο αλληλομόρφων. Ωστόσο, χρειάζεται περαιτέρω ερευνητική μελέτη σε μεγαλύτερο και πιο αντιπροσωπευτικό δείγμα, ασθενών και δειγμάτων αναφοράς, για επιβεβαίωση των αποτελεσμάτων αυτών. |
| author2 |
Πατρινός, Γεώργιος |
| author_facet |
Πατρινός, Γεώργιος Χονδρού, Γεωργία |
| format |
Thesis |
| author |
Χονδρού, Γεωργία |
| author_sort |
Χονδρού, Γεωργία |
| title |
Διερεύνηση της συσχέτισης γενετικών τόπων με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας σε Καυκάσιους ασθενείς |
| title_short |
Διερεύνηση της συσχέτισης γενετικών τόπων με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας σε Καυκάσιους ασθενείς |
| title_full |
Διερεύνηση της συσχέτισης γενετικών τόπων με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας σε Καυκάσιους ασθενείς |
| title_fullStr |
Διερεύνηση της συσχέτισης γενετικών τόπων με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας σε Καυκάσιους ασθενείς |
| title_full_unstemmed |
Διερεύνηση της συσχέτισης γενετικών τόπων με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας σε Καυκάσιους ασθενείς |
| title_sort |
διερεύνηση της συσχέτισης γενετικών τόπων με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας σε καυκάσιους ασθενείς |
| publishDate |
2022 |
| url |
https://hdl.handle.net/10889/24144 |
| work_keys_str_mv |
AT chondrougeōrgia diereunēsētēssyschetisēsgenetikōntopōnmetēnemphanisētēsschizophreneiassekaukasiousastheneis AT chondrougeōrgia investigationoftheassociationofgeneticvariantswiththeoccurrenceofschizophreniaincaucasianpatients |
| _version_ |
1771297225317548032 |
| spelling |
nemertes-10889-241442022-12-08T04:37:09Z Διερεύνηση της συσχέτισης γενετικών τόπων με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας σε Καυκάσιους ασθενείς Investigation of the association of genetic variants with the occurrence of schizophrenia in Caucasian patients Χονδρού, Γεωργία Πατρινός, Γεώργιος Πατρινός, Γεώργιος Σπυρούλιας, Γεώργιος Πουλάς, Κωνσταντίνος Chondrou, Georgia Ποιοτική μετα-ανάλυση Σχιζοφρένεια Γονίδια Γενετική βάση Συσχέτιση Γονότυποι Αλληλόμορφα Καυκάσιοι πληθυσμοί Μη Καυκάσιοι πληθυσμοί Qualitative meta-analysis Schizophrenia Genes Genetic base Association Genotypes Alleles Caucasian cohort Non Caucasian cohort STT3A IL3A MSI2 616.898 071 Η σχιζοφρένεια αποτελεί την πιο σοβαρή και πολύπλοκη ψυχιατρική διαταραχή, η οποία εμφανίζεται σε περίπου 1% του γενικού πληθυσμού. Παρόλο που η αιτιολογία της σχιζοφρένειας παραμένει άγνωστη, είναι γνωστό πως τόσο οι περιβαλλοντικοί όσο και οι γενετικοί παράγοντες παίζουν σημαντικό ρόλο στην εμφάνισή της. Οι περιβαλλοντικοί παράγοντες αφορούν κυρίως γεγονότα πριν τη γέννηση του ατόμου, επιπλοκές κατά τον τοκετό, λοιμώξεις, τον τόπο και την εποχή γέννησης του ατόμου, καθώς και κοινωνικούς παράγοντες. Ωστόσο, το γενετικό υπόβαθρο του ατόμου φαίνεται να αποτελεί τον πιο ισχυρό παράγοντα επίδρασης στην εμφάνιση της νόσου. Σύμφωνα με μελέτες συσχετισμού ολόκληρου του γονιδιώματος και στρατηγικής υποψήφιων γονιδίων, έχει βρεθεί ότι πολλά γονίδια σχετίζονται με την εμφάνιση της νόσου. Επιπλέον, σύμφωνα με μελέτες που έχουν γίνει σε άτομα της ίδιας οικογένειας, έχει δειχθεί ότι συγγενείς ασθενών με σχιζοφρένεια έχουν μεγαλύτερο κίνδυνο εμφάνισης της νόσου. Στην παρούσα μελέτη, πραγματοποιήθηκε, αρχικά, βιβλιογραφική ανασκόπηση άρθρων που μελετούσαν γονίδια και γενετικές αλλαγές που σχετίζονταν με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας, ανεξάρτητα από την προέλευση του εξεταζόμενου δείγματος. Συνολικά συλλέχθηκαν 188 μελέτες οι οποίες αφορούσαν Καυκάσιους και μη Καυκάσιους πληθυσμούς. Στις μελέτες αυτές συμμετείχαν συνολικά 393.617 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 620.314 δείγματα αναφοράς. Στη συνέχεια, έγινε ποιοτική μετα-ανάλυση των δεδομένων αυτών και βρέθηκαν 18 γενετικές αλλαγές που εμφάνιζαν στατιστική σημαντικότητα (pvalue < 0.001) και είχαν μελετηθεί αποκλειστικά σε δείγμα μη Καυκάσιων πληθυσμών. Οι γενετικές αλλαγές αυτές αφορούν συνολικά 14 γονίδια, τα οποία κωδικοποιούν μεταγραφικούς παράγοντες, διαμεμβρανικές πρωτεΐνες, γλυκοπρωτεΐνες, ιοντικούς διαύλους και υποδοχείς που παίζουν σημαντικό ρόλο σε ποικίλες κυτταρικές δραστηριότητες και στην ανάπτυξη διαφόρων συστημάτων. Έπειτα, με κριτήριο την παράμετρο pvalue, επελέγησαν για περαιτέρω μελέτη, σε Καυκάσιους πληθυσμούς, οι πολυμορφισμοί rs548181, rs6645249 και rs9892791. Οι πολυμορφισμοί αυτοί βρίσκονται στα γονίδια STT3A, IL3A και MSI2 αντίστοιχα. Σκοπός της μελέτης αυτής είναι η διερεύνηση της συσχέτισης των γενετικών τόπων αυτών με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας στους εκάστοτε εξεταζόμενους Καυκάσιους πληθυσμούς. Συγκεκριμένα, για τη μελέτη του rs548181 του γονιδίου STT3A γονοτυπήθηκαν, με τη μέθοδο RFLP, 25 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 24 δείγματα αναφοράς ελληνικού πληθυσμού. Επίσης, για τον rs6645249 του IL3A αναλύθηκαν, με τη μέθοδο RFLP, 20 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 33 δείγματα αναφοράς ελληνικού πληθυσμού και 10 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 8 δείγματα αναφοράς σλοβένικου πληθυσμού. Τέλος, ο rs9892791 του MSI2 μελετήθηκε με τη μέθοδο γονοτύπησης Sanger Sequencing σε δείγματα Ελλήνων, Κροατών και Σλοβένων. Αναλυτικά, γονοτυπήθηκαν 14 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 43 δείγματα αναφοράς για τον ελληνικό πληθυσμό, 11 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 39 δείγματα αναφοράς για τον κροατικό πληθυσμό και 19 δείγματα ασθενών με σχιζοφρένεια και 26 δείγματα αναφοράς για τον σλοβένικο πληθυσμό. Τέλος, πραγματοποιήθηκε στατιστική ανάλυση των αποτελεσμάτων γονοτύπησης των μελετούμενων δειγμάτων, η οποία δεν κατέδειξε στατιστικά σημαντική συσχέτιση των εξεταζόμενων πολυμορφισμών με την εμφάνιση της σχιζοφρένειας στους εξεταζόμενους πληθυσμούς, ούτε σε επίπεδο γονοτύπων ούτε σε επίπεδο αλληλομόρφων. Ωστόσο, χρειάζεται περαιτέρω ερευνητική μελέτη σε μεγαλύτερο και πιο αντιπροσωπευτικό δείγμα, ασθενών και δειγμάτων αναφοράς, για επιβεβαίωση των αποτελεσμάτων αυτών. Schizophrenia is the most severe and complex psychiatric disease, which occurs in approximately 1% of the general population. Although schizophrenia’s etiology remains unclear, it is well documented that both environmental and genetic factors play a significant role. Environmental factors include prenatal events and obstetric complications, infections, as well as the place and time of birth and social reasons. However, the genetic profile seems to be the strongest variable behind schizophrenia’s etiology. According to Genome Wide Association Studies (GWAS) and candidate gene strategies, some genes seem to be associated with schizophrenia’s development. In addition, according to family studies, relatives of schizophrenic patients have higher risk on developing schizophrenia. In our study, we first conducted a literature review, focusing on genes and genetic variants correlated with the development of schizophrenia, regardless of race and/or population. In total, 188 studies were collected concerning Caucasian and non- Caucasian populations, in which 393.617 cases and 620.314 healthy individuals participated. Next step was the performance of a qualitative meta- analysis, which was leaded to 18 genetic variants associated with the development of schizophrenia in non- Caucasian cohorts. These genetic variants are located in 14 genes, which encode transcription factors, enzymes, transmembrane proteins, glycoproteins, ion channels and receptors that play important roles in various cellular activities and the development of multiple systems. The aim of our study was to validate the association of these variants with the development of schizophrenia in a Caucasian cohort. For this reason, the polymorphisms rs548181, rs6645249 and rs9892791 located in STT3A, IL3A, MSI2 genes respectively were chosen for further analysis in a Caucasian cohort. In particular, for further study of rs548181 of STT3A gene, 25 cases and 24 controls of Greek origin were genotyped with RFLP method. In addition, as far rs6645249 of IL3A is concerned, 20 cases and 33 controls of Greek origin and 10 cases and 8 controls of Slovenian origin were also genotyped with RFLP method. Finally, rs9892791 of MSI2 gene was studied in Greek, Croatian and Slovenian samples with Sanger Sequencing Analysis. More specifically, 14 cases and 43 controls were analysed of Greek cohort, 11 cases and 39 controls of Croatioan cohort and 19 cases and 26 controls of Slovenian cohort. According to results, no statistical significance was detected. Consequently, no one of these genetic variants seems to have neither genotypic nor allelic association with the development of schizophrenia. However, further study, with larger sample of cases and controls, is necessary, in order to validate the current results. 2022-12-07T08:07:03Z 2022-12-07T08:07:03Z 2017-08 Thesis https://hdl.handle.net/10889/24144 gr 12 application/pdf |
